『アリス』の物語構造は、特定の対象を求める探求ではなく、物理法則と論理が流動的な世界において、安定性を執拗に追い求めることに基づいている。物語は、アリスの厳格なヴィクトリア朝的な躾と、不思議の国の混沌とした弾力性との間の、エスカレートする一連の対立として展開される。主要な構造的モチーフは「境界」である。アリスは絶えず移行し続け、決して完全に到着することはない。最初のウサギの穴への落下——時間のゆっくりとした夢のような停止——から、庭への苛立たしい障壁となる鍵のかかった扉まで、物語は「存在」ではなく「生成」の状態を強調している。この確固たる基盤の欠如が、持続的な圧力点を生み出す。それがアリスのアイデンティティの危機である。彼女の肉体的形態が絶えず変動し続ける——10インチに縮み、9フィートに伸び、部屋いっぱいに膨らむ——ため、自己の内的感覚が溶解していく。青虫の尋問（「お前は誰だ」）は、この不安の核心を突き、アイデンティティが生得の本質ではなく、記憶と知覚の機能であることを示唆する。そしてこの夢の世界では、その両方ともが当てにならないのである。
アリスが出会う社会的相互作用は、大人の世界の風刺的な歪曲として機能し、礼儀作法と教育を暴力と不条理の源泉へと変える。「コーカス・レース」は、不思議の国のルールを確立する重要な構造的瞬間である。それは始まりも終わりもない円形のレースであり、結果が恣意的な世界における努力の無益さを強調している。アリスが受け取る賞品——彼女自身の指ぬき——は、彼女の報酬の再帰的で自己言及的な性質を浮き彫りにする。彼女はすでに持っていたもの以外には何も得ていない。この無意味な報酬のモチーフは、正義が転倒する裁判の場面で反響する。これらの場面における圧力は、アリスの論理的対話への欲求と、住人たちのナンセンスへの執着との衝突から生じる。彼女がネズミや偽亀と会話しようとするとき、彼女の共感の試みは言語的な駄洒落と生物学的な捕食（彼女の猫ダイナ）によって妨げられ、コミュニケーションが必然的に疎外につながる社会的摩擦を生み出す。
物語が王宮へと進行するにつれて、賭けは肉体的な欲求不満から実存的な危険へと移行するが、その危険は奇妙に空虚なままである。ハートの女王は、恣意的な権威の究極の圧力点を表している。彼女の決まり文句である「首をはねろ」は、実際の結果を伴わずに高レベルの緊張を維持する構造的装置である。グリフォンは後に、誰も実際には首をはねられていないことを確認する。この脅威と現実の乖離は、本書の夢の論理を映し出している。クロケットの試合は、宮廷の無秩序の縮図として機能する。モールは生きたフラミンゴ、ボールはハリネズミ、そしてルールは存在しない。ゲームをプレイしようとするアリスの苦闘は、混沌のために設計されたシステムに秩序を課そうとする彼女の無益な試みを反映している。チェシャ猫が自由に現れたり消えたりし、笑顔だけを残す能力は、場面をさらに不安定にし、不思議の国では存在そのものが任意であることを示唆している。
ジャックの裁判は、物語の論理のクライマックス的な解体として機能する。司法プロセスは盗まれたタルトと矛盾する証拠の茶番であり、王がその場で「第四十二条」をでっち上げることで頂点に達する。この瞬間は、小説の結末への解釈の手がかりを提供する。不思議の国のルールは単に異なるだけでなく、存在せず、権力者が統制の幻想を維持するために捏造されたものである。裁判中のアリスの成長は、重要な構造的転換である。彼女が物理的に膨張するにつれて、彼女の自信は固まっていく。彼女は、環境の受動的な犠牲者——その制約に合わせて縮小する——から、幻想を完全に拒絶する能動的な主体へと移行する。彼女が「あなたたちはただのトランプのカードよ」と宣言するとき、彼女は夢の魔法を打ち破り、潜在意識のナンセンスに対する目覚めた現実の優位性を主張する。覚醒は穏やかなフェードアウトではなく、激しい中断である。カードが彼女に向かって舞い上がり、不条理から逃れる唯一の方法が、その妥当性を攻撃的に否定することであることを示している。